伊本·图菲勒写有医学、天文学和哲学方面的大量著作。但他的著作大多轶散，在阿拉伯文献中仅有零散的记载。流传迄今的哲理性文学著作《哈伊·本·亚克赞》(Hayy ben Yaqzan)，其含义为“人智来自神智”。

　　该书主人公哈伊取自伊本·西那的一篇著作名，通过故事阐发其哲学思想和观点。故事描述了居住在与世隔绝的孤岛上的“自然人”的自我发展过程。哈伊不依赖社会传统，不借助天启，不需他人传授的知识，而借助自身的自然成长和对外界的观察和认识，经过不同的发展阶段，先认识个别事物，得出感性认识，经过积累逐渐认识了周围世界，得到了自然的知识，后从多种多样的事物中认识了联结这些事物的原则，终于达到对自然、诸天体、自身及对真主的真理性的认识。在宇宙结构问题上，伊本·图菲利认为，整个宇宙是由球形实体所构成，地球是圆形的，太阳是比地球大得多的球形实体。宇宙似一巨人，各个天体相互联系，宛如巨人身上的各个器官。自然界的万物都具有一定的长、宽、厚的实体，都是有限的，·是可以认识的。一切实体因各具不同属性，故多种多样，但它们统一于精神实体(造物主)。宇宙及万物不是固有的，而是由造物主造化出来的。他认为，万物运动的本原是“真主的真理”，真主主宰这个世界，并使它运动。在认识论上，伊本·图菲利把人的认识分为直观认识和理性认识两种。前者通过感官与外界接触，再经过锤炼灵魂而获得，后者在直观认识的基础上。通过研究和理性推理而实现。只有理性的认识才能达到自然的真理。他受新柏拉图主义和苏菲派神秘主义的影响，认为只有通过沉思冥想、内心参悟，才能理解“真主的真理”和接近真主。他还认为宗教和哲学是和谐的，通过殊途达到同一真理。但一般人由于知识和能力的限制，只能信奉简单的宗教信条，而不能达到最高真理，少数贤哲则能认识“真主的真理”的真谛，而真正达到完全领悟真主的启示和玄机的人则为“圣者”。伊本·图菲勒还提出了时间和空间是永恒的，自然界是运动变化的，生物来源于非生物的进化思想。